バニラエアとJR北海道はタイアップし、バニラエアに搭乗した方限定で「JRフリーパス」を販売しています。
販売されるのは「バニラエアきた北海道フリーパス」と「バニラエアひがし北海道フリーパス」の2種類。
今回から新たに25歳以下の方を対象とする「25歳以下用（U25）」も登場しました。
■「バニラエアひがし北海道フリーパス」
バニラエアひがし北海道フリーパスは、新千歳空港、札幌、小樽、富良野、美瑛、旭川、網走、知床、釧路、帯広など道東エリアが対象で、JRの特急・普通列車（快速含む）の普通車自由席が自由に乗り降りできます。
発売場所は新千歳空港駅みどりの窓口。
バニラエアの搭乗券（新千歳空港到着便）を提示すると購入できます。
販売は搭乗当日のみで前売りはありません。
発売期間：一般用2018年3月31日まで、25歳以下用（U25）2017年10月1日～2017年11月30日
利用期間：一般用2018年4月4日まで、25歳以下用（U25）2017年10月1日～2017年12月4日
有効期間：5日間
価格：一般用大人15,500円、子ども（6歳～12歳未満）7,750円、25歳以下用（U25）12,000円
■「バニラエアきた北海道フリーパス」
バニラエアきた北海道フリーパスは、新千歳空港、札幌、小樽、富良野、美瑛、旭川、稚内など道北エリアが対象で、JRの特急・普通列車（快速含む）の普通車自由席が自由に乗り降りできます。
発売場所は新千歳空港駅みどりの窓口。
バニラエアの搭乗券（新千歳空港到着便）を提示すると購入できます。
販売は搭乗当日のみで前売りはありません。
発売期間：一般用2018年3月31日まで、25歳以下用（U25）2017年10月1日～2017年11月30日
利用期間：一般用2018年4月3日まで、25歳以下用（U25）2017年10月1日～2017年12月3日
有効期間：4日間
価格：一般用大人12,500円、子ども（6歳～12歳未満）6,250円、25歳以下用（U25）10,000円
フリーパスはどちらも北海道の中心部は利用できるので、稚内方面に行きたい方は「きた北海道フリーパス」、知床方面に行きたい方は「ひがし北海道フリーパス」ですね。
今回から設定された「25歳以下用（U25）」ですが、中高生・大学生・社会人になったばかりの方などに、より気軽に北海道の旅を満喫してもらえるとしています。